在孩子出生前的二三十年里，母親通過正常的生活過程在乳頭和乳頭周圍的皮膚和導管上積累了一些有益的正常細菌。通過母乳喂養，將人體正常菌群的種子輸送給兒童。對孩子和他們的生活的好處是不可估量的。但是現在很多父母很容易放棄這種自然的過程，或者感覺乳頭和前乳臟了。

1980年美國臨床營養雜志出版了一篇論文“母乳喂養對新生兒腸道雙歧菌群的影響“作者為H. Beerens, C. Romond, 和 C. Neut三位醫生。三位指出用不同組合的雙歧桿菌喂養嬰兒，雙歧桿菌的數量可能相近，但種類有差別。這些差別會對健康產生很大的影響。這項研究還顯示用牛乳和母乳喂養的嬰兒的主要區別在于牛乳喂養的寶寶會存在很高含量且危險的擬桿菌屬，梭菌屬和大腸桿菌屬細菌。這樣的高含量也不會隨著孩子的長大而降低。

人體腸道正常菌群的建立，最初來自母乳喂養，喂奶的過程，不僅對于孩子的先天免疫，對獲得性免疫都非常重要。雖然乳汁是一種非常有營養的液體，不需要加溫，不需要消毒。但母乳喂養不是無菌的過程，是個有菌的過程的。而這些菌不是任意來的，是媽媽在生育孩子二、三十年前就開始準備了。

母乳喂養不僅為孩子提供營養素,還完成孩子腸道正常菌群的建立，可以調節嬰兒的免疫功能，促進腸道的成熟，完善嬰兒正常免疫功能。使孩子對食物逐漸產生耐受的狀態，對今后能夠接受更多、更豐富的食物奠定基礎。

在檢查了各種可以增強嬰兒胃腸道中有益菌的定殖的食物來源后，醫生的結論是人乳仍然是最好的。他們這樣寫到：沒有其它哺乳動物的乳汁能促進雙歧桿菌的生長（B. infantis, B. bifidum, and B. longum）。這表明在人乳中存在一種特殊的因子即我們今天熟知的“雙歧因子”。